研究内容

環境中の変形菌類を対象とした分子生態学的解析

変形菌類は世界中に遍在する原生生物で、森林を主要な生息場所としています。ライフステージのひとつである子実体は多種多様な形態を示し、多くの関心を集め続けてきました。その結果として、子実体の形態や出現する時期・場所などに関しては数多くの知見が蓄積され続けています。また、運動性を持つ多核体である変形体から子実体が形成される過程も研究者の注目を集め、特定の種は実験生物として細胞生物学の発展に大きな貢献を果たしてきました。しかしながら、変形菌類の野外における生態についての研究は限られたものに留まっており、特に子実体以外のライフステージにあるものの環境中での挙動はほとんど明かされていません。こうした制限が生じる主な要因として、汎用可能な培養法が確立されていない点と、子実体以外のライフステージにあるものを同定する適切な方法がないことが考えられます。このような問題を解決する手段として、分子生態学的な手法を用いての解析を進めています。変形菌研究への新たな手法の導入により、培養と形態による同定を基盤とした従来の研究を補完し、環境中における変形菌類の生態をより詳細に解明することを目指しています。

<成果等>
  1. Akiko Kamono, Marianne Meyer, Thomas Cavalier-Smith, Manabu Fukui and Anne Maria Fiore-Donno. Exploring slime mould diversity in high altitude forests and grasslands by environmental RNA analysis. FEMS Microbiology Ecology 84: 98-108. 2013.
  2. Anne Maria Fiore-Donno, Akiko Kamono, Marianne Meyer, Martin Schnittler, Manabu Fukui and Thomas Cavalier-Smith. 18S rDNA phylogeny of Lanmproderma and allied genera (Stemonitales, Myxomycetes, Amoebozoa). PLoS ONE 7: e35359. 2012.
  3. Anne Fiore-Donno, Akiko Kamono, Ema Chao, Manabu Fukui and Thomas Cavalier-Smith. Invalidation of hyperamoeba by transferring its species to other genera of Myxogastria. Journal of Eukaryotic Biology 52: 189-196. 2010.
  4. Akiko Kamono, Hisaya Kojima, Jun Matsumoto, Kimitaka Kawamura and Manabu Fukui. Airborne Myxomycete spore: Detection using molecular techniques, Naturwissenschaften 96: 147-151.2009.
  5. Akiko Kamono, Jun Matsumoto, Hisaya Kojima, and Manabu Fukui. Characterization of myxomycete communities in soil by reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR)-based method. Soil Biology and Biochemistry 41: 1324-1330. 2009.
  6. Akiko Kamono and Manabu Fukui. Rapid PCR-based method for detection and differentiation of Didymiaceae (Myxomycetes) in emvironmental samples. Journal of Microbiological Methods 67: 496-506. 2006.