年表
| 昭和 | 16年 | 11月 | 低温科学研究所設置
物理学部門、応用物理学部門、気象学部門、
海洋学部門、生物学部門、医学部門設置
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| 昭和 | 38年 | 4月 | 雪害科学部門増設 |
| 昭和 | 39年 | 4月 | 凍上学部門増設 |
| 昭和 | 40年 | 4月 | 附属流氷研究施設設置（紋別市） |
| 昭和 | 40年 | 11月 | 雪崩観測室新築（幌延町問寒別） |
| 昭和 | 41年 | 3月 | 附属流氷研究施設庁舎(449m²)新築 |
| 昭和 | 41年 | 4月 | 植物凍害科学部門増設 |
| 昭和 | 43年 | 3月 | 研究棟(2,892m²)新築 |
| 昭和 | 43年 | 11月 | 低温棟(2,342m²)新築 |
| 昭和 | 45年 | 4月 | 融雪科学部門増設 |
| 昭和 | 46年 | 10月 | 附属流氷研究施設庁舎(183m²)増築 |
| 昭和 | 47年 | 11月 | 凍上観測室新築（苫小牧市） |
| 昭和 | 48年 | 4月 | 低温生化学部門増設 |
| 昭和 | 50年 | 12月 | 研究棟(1,065m²)増築 |
| 昭和 | 53年 | 2月 | 附属流氷研究施設宿泊棟(338m²)新築 |
| 昭和 | 53年 | 10月 | 融雪観測室新築（幌加内町母子里) |
| 昭和 | 54年 | 4月 | 医学部門を生理学部門に転換
生物学部門を動物学部門に、低温生化学部門を生化学部門に名称変更
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| 昭和 | 56年 | 4月 | 降雪物理学部門増設 |
| 平成 | 3年 | 4月 | 降雪物理学部門廃止、雪氷気候物理学部門増設 |
| 平成 | 7年 | 4月 | 全国共同利用の研究所に改組
寒冷海洋圏科学部門、寒冷陸域科学部門、
低温基礎科学部門、寒冷圏総合科学部門
の４大部門を設置
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| 平成 | 9年 | 3月 | 分析棟(1,622m²)増築 |
| 平成 | 12年 | 3月 | 研究棟新館(2,441m²)増築 |
| 平成 | 15年 | 12月 | 実験棟（旧低温棟）改修 |
| 平成 | 16年 | 4月 | 附属流氷研究施設（紋別）を廃止・転換し、環オホーツク観測研究センター設置（札幌） |
| 平成 | 16年 | 10月 | 凍上観測室（苫小牧市）を森林生態系観測室に変更 |
| 平成 | 20年 | 3月 | 研究棟改修 |
| 平成 | 20年 | 10月 | 組織改編
共同研究推進部を設置し、研究部門を４大部門から３大部門（水・物質循環部門、雪氷新領域部門、生物環境部門）に変更
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| 平成 | 22年 | 4月 | 共同利用・共同研究拠点に認定される |